IMTECH Home ProPred-I  
The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
Home References Help Matrices Team Contact

 

Allele HLA-A20
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
C:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
D:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
E:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
F:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
5.000
G:
1.000
0.500
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
H:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
I:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
3.000
K:
1.000
100.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
10.000
L:
1.000
3.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
5.000
M:
1.000
5.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
3.000
N:
1.000
2.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
P:
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
Q:
1.000
2.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
R:
1.000
2.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
40.000
S:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
T:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
V:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
3.000
W:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
Y:
1.000
0.100
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
5.000
FINAL CONSTANT1.000
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
120
80
40
30
20
10
10
4
1
0.1

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder