IMTECH Home ProPred-I  
The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
Home References Help Matrices Team Contact

 

IMMUNOPROTEASOME
Amino acid/Position
P6
P5
P4
P3
P2
P1
P1'
P2'
P3'
P4'
P5'
P6'
A:
0.680
0.615
0.940
0.420
0.590
0.745
1.440
0.665
0.560
0.775
0.480
0.810
C:
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
D:
0.725
0.360
0.190
0.225
0.160
0.150
0.335
1.210
0.255
0.325
0.220
0.375
E:
0.300
0.370
0.515
0.870
0.580
0.155
0.255
0.320
0.410
0.270
0.400
0.515
F:
0.000
0.495
0.280
0.105
0.665
0.550
0.050
0.100
0.120
0.260
0.190
0.250
G:
0.500
0.550
0.485
0.180
0.360
0.170
0.880
0.475
0.970
0.265
0.465
0.675
H:
0.300
0.030
0.080
0.285
0.205
0.130
0.140
0.040
0.050
0.040
0.340
0.285
I:
0.440
0.345
0.290
0.470
0.145
0.585
0.020
0.800
0.295
0.420
0.730
0.395
K:
0.090
0.475
0.400
1.065
0.620
0.175
0.450
0.275
0.290
0.405
0.590
0.830
L:
0.560
0.975
0.450
0.235
0.160
2.305
0.065
0.370
1.025
0.410
0.105
0.510
M:
0.020
0.000
0.215
0.010
0.080
0.050
0.295
0.000
0.000
0.100
0.000
0.050
N:
0.245
0.285
0.290
0.165
0.205
0.095
0.520
0.290
0.560
0.575
0.190
0.290
P:
0.325
0.370
0.255
0.380
0.035
0.000
0.375
0.175
0.305
0.180
0.440
0.080
Q:
0.010
0.260
0.210
0.105
0.170
0.010
0.175
0.075
0.225
0.250
0.100
0.020
R:
0.365
0.100
0.065
0.215
0.395
0.200
0.480
0.000
0.190
0.290
0.320
0.100
S:
0.545
0.250
0.610
0.225
0.735
0.185
0.345
0.320
0.265
0.695
0.380
0.520
T:
0.890
0.200
0.085
0.235
0.570
0.195
0.310
0.560
0.275
0.195
0.275
0.055
V:
0.255
0.485
0.585
0.940
0.695
0.320
0.085
0.535
0.495
0.555
0.925
0.610
W:
0.025
0.060
0.000
0.025
0.000
0.070
0.000
0.000
0.000
0.075
0.000
0.000
X:
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
Y:
0.095
0.140
0.425
0.215
0.000
0.280
0.150
0.160
0.080
0.285
0.220
0.000
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
7.855
7.435
7.165
6.95
6.765
6.595
6.425
6.25
6.03
5.11

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder