IMTECH Home ProPred-I  
The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
Home References Help Matrices Team Contact

 

PROTEASOME
Amino acid/Position
P6
P5
P4
P3
P2
P1
P1'
P2'
P3'
P4'
P5'
P6'
A:
0.865
0.595
1.020
0.485
0.620
0.825
1.545
0.330
0.710
0.590
0.930
0.365
C:
0.000
0.000
0.000
0.000
0.130
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
D:
0.580
0.460
0.255
0.215
0.185
0.805
0.300
1.185
0.315
0.235
0.170
0.400
E:
0.530
0.465
0.385
0.455
0.250
0.605
0.300
0.275
0.460
0.150
0.465
0.440
F:
0.050
0.275
0.430
0.165
0.430
0.145
0.190
0.250
0.165
0.575
0.220
0.050
G:
0.300
0.575
0.750
0.230
0.545
0.175
0.185
0.415
0.760
0.185
0.320
0.780
H:
0.175
0.125
0.010
0.150
0.280
0.065
0.165
0.110
0.065
0.035
0.385
0.090
I:
0.505
0.125
0.385
0.335
0.180
0.510
0.060
0.845
0.220
0.450
0.405
0.170
K:
0.220
0.580
0.240
0.945
0.455
0.080
0.365
0.115
0.370
0.675
0.600
0.655
L:
0.540
0.550
0.535
0.525
0.230
1.185
0.345
0.900
1.120
0.435
0.670
0.565
M:
0.010
0.000
0.095
0.010
0.015
0.035
0.070
0.040
0.075
0.065
0.010
0.060
N:
0.120
0.285
0.235
0.140
0.240
0.095
0.390
0.215
0.195
0.160
0.270
0.730
P:
0.365
0.475
0.550
0.365
0.095
0.040
0.480
0.020
0.255
0.240
0.330
0.315
Q:
0.045
0.260
0.025
0.020
0.340
0.060
0.075
0.060
0.155
0.305
0.035
0.075
R:
0.125
0.045
0.045
0.425
0.290
0.275
0.595
0.095
0.155
0.145
0.080
0.060
S:
0.575
0.365
0.380
0.090
0.535
0.395
0.500
0.215
0.170
0.530
0.490
0.555
T:
0.735
0.460
0.140
0.365
0.365
0.140
0.150
0.430
0.140
0.360
0.250
0.105
V:
0.270
0.380
0.365
0.920
0.840
0.450
0.275
0.410
0.695
0.705
0.355
0.695
W:
0.040
0.015
0.035
0.030
0.020
0.030
0.000
0.050
0.000
0.000
0.050
0.010
X:
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
0.000
Y:
0.085
0.100
0.255
0.265
0.090
0.220
0.145
0.175
0.110
0.295
0.100
0.015
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
7.16
6.815
6.59
6.42
6.265
6.13
5.99
5.83
5.635
4.835

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder